犬のマイクロウイルス感染症は、短期間で急速に悪化するのが特徴で、心筋炎症候群はしばしば放置され、突然死に至ります。腸炎症候群の犬を迅速に治療することで、死亡する確率を大幅に減らすことができます。腸炎症候群の治療の原則は、ウイルス増殖の抑制、二次感染の抑制、制吐・止瀉療法、輸液、体内の酸塩基中毒やイオン障害の是正、さらに栄養剤注射などの必要な支持療法です。ウイルスの増殖抑制には犬用モノクローナル抗体やインターフェロン、細菌の二次感染抑制にはセフトリアキソンナトリウムやアンピシリンナトリウムを含む薬剤が主に使用されます。嘔吐がひどい場合には、エモロールやマロピタント塩酸塩などの成分を含む薬剤が使用されることもあります。マイクロウイルス感染症は犬にとって重大な感染症であり、一定の死亡率もあるため、一般的に飼い主が個人で治療することは勧められません。科学的かつ合理的な治療によってのみ、犬の治癒率をより確実にすることができるのです。
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