愛犬が小頭症かどうかを判断するには、白血球の減少が小頭症の可能性を示しているため、定期的に血液検査を行い、白血球の減少を確認する必要があります。 また、感染を示す陽性コントロールドットがあるかどうかの検査も可能です。 また、蛍光定量PCRを行い、陽性であれば感染していることが分かります。 小頭症の初期には、犬は食欲不振、嘔吐、抑うつ、下痢、発熱が頻繁に起こり、糞便は通常灰色か黄色、あるいは乳白色になることもあります。 後期になると、犬は頻繁に激しく嘔吐し、糞便は悪臭を放ち、色は醤油色やトマトの血色に変化します。 犬は脱水症状を起こし、やせ細り、目はくぼみ、鼻は乾き、病状は急速に進行します。
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